从某种意义上来说，正是因为有了这样的大悲心，才成就了佛果。《大方广佛华严经》有云:“诸佛如来以大悲心而为体故。因于众生而起大悲，因于大悲生菩提心，因菩提心成等正觉。譬如旷野沙债之中有大树王，若根得水，枝叶、华果悉皆繁茂。生死旷野菩提树王，亦复如是。一切众生而为树根，诸佛菩萨而为华果，以大悲水饶益众生，则能成就诸佛菩萨智慧华果。何以故?若诸菩萨以大悲水饶益众生，则能成就阿褥多罗三藐三菩提故。是故菩提属于众生，若无众生，一切菩萨终不能成无上正觉。”敦煌发现的《药师经疏》卷1有云:

    第七愿者。此下两愿就慈悲体为一双。初一愿是悲愿，就此中复分为之，第〔一〕标数，第二兴愿，即出悲体，第三下施众生。第七愿初标数，“使我来世”此下第二兴愿。就兴愿中复为三:第一出悲家境，第三[二」正明悲体。“若有苦恼无救护”者，此明悲境。“我为此等设大法药”，第二正出悲体。“令诸疾病皆得除愈”，第三回施众生。

    这个疏所引的经文与现存诸译本都不同，方广铝认为这个经文“或为僧佑《出三藏记集》卷5所载‘宋孝武帝大明元年株陵鹿野寺比丘慧简依经抄撰’所成之本”。

    药师经的注疏多已不存，唐宋期间的注疏，现仅存太贤《药师经古迹》二卷。其余的注疏仅有名目保留在高丽、日本等来华僧人所撰写的目录中。平柞《法相宗章疏》记有靖迈《药师经疏》一卷，藏俊《注进法相宗章疏》除靖迈疏之外，还记有遁伦、善珠、窥基三人各著《药师经疏》一卷。永超《东域传灯目录》，除窥基、靖迈、遁伦外，极太、百济义容、善珠、神泰《药师经疏》各一卷，太贤《药师经古迹》一卷。高丽义天《新编诸宗教藏总录》中，除靖迈、遁伦《疏》外，又记有憬兴《药师经疏》一卷，智开《药师经疏》二卷，太贤《药师经古迹记》一卷，神雄《药师经集异钞》一卷，圆镜《药师经义玄抄》四卷、《药师经科》一卷，神昙《灌顶经疏》一卷。在诸目录中，只有义天《新编诸宗教藏总录》即有《灌顶经疏》，作者为神昙。这个“神昙”很可能是“神泰”之误。《东域传灯目录》中，其他疏文都记为“同经疏”，唯神泰的《疏》则记为“同疏”，这既有可能是抄写是的疏漏，也有可能是神泰《疏》不是玄奖译本，而是《灌顶经》的相应部分。现存《大正藏》八十五册中所收的这个《药师经疏)) 里面有大量的阿毗达摩教理，而神泰精通《俱舍论》，并作有《俱舍论疏》，这两个《疏》的内容也有相似的地方，比如都出现了尊者“奢摩达多”等。因此，敦煌的这个((疏》的作者很可能是神泰。当然，也有可能他仅仅是流行于敦煌地区的一种讲经文献。根据《疏》文，七、八二愿表示慈悲，其中，第七愿表示药师佛之大悲。“有苦恼无救护”，在玄奖的译本中具体指出几种情形，即:“众病逼切，无救无归，无医无药，无亲无家，贫穷多苦。”此为悲境。依此境而起悲心，施众生大法药，即是悲体。依此悲体而起大用，使得众生闻药师名号，即得解脱诸苦，趣证菩提，此即回施众生。玄奖译本中谓:“我之名号，一经其耳，众病悉得除，身心安乐，家属资具，悉皆丰足，乃至证得无上菩提。”清代灵耀法师在《药师经直解》中，认为药师佛第六至第十二愿“皆众生无边誓愿度之大悲拔苦”。