宝峰寺水陆壁画规模较大，曾遍布水陆殿四壁。水陆壁画呈平行式构图，遵从上方原则。与明代其他寺观水陆壁画不同的是，宝峰寺并未将主佛尊绘于东、西壁，而是完整的绘于北壁。从现存的情况看，北壁上层绘有佛、菩萨像，下层绘其对应的明王像。东、西壁则绘各佛道神抵，总体呈平行式构图。南壁则是东西壁神抵的延伸。宝峰寺水陆壁画色彩艳丽，惟妙惟肖，线条的勾勒，花纹的装饰，色彩的填充均属上乘。这其中尤以色彩及花纹最为出彩。从遗存的壁画来看，画师多用黄、青、红、黑、白五种色彩。各色彩基本用于神抵服饰的装饰，且多用三种以上的颜料填充，使得神抵活灵活现，富有生机，极为吸引人眼球，再加上灰白色的背景装饰，与神抵多色彩的服饰形成鲜明的对比，这种强烈的色彩反差，配合神抵不同的面部表情，对信众的教育意义大于观赏意义。花纹的使用在北壁各菩萨所坐莲花台及东、西壁神抵服饰中较为多见。北壁菩萨所坐莲花台多用锦地纹装饰，背景光圈多用云雷纹，使其看起来雍容华贵。东、西壁神抵服饰多用锦地纹，配合线条的勾勒，给人一种赏心悦目之感，也侧面反映了画师的技艺。